问题1：
mui.css里面默认设置body,html的背景颜色为灰色，如果需要修改，可以用css覆盖修改。
动画设置，打开新webview的动画，可以自己调整，参考[相关的API](http://www.html5plus.org/doc/zh_cn/webview.html#plus.webview.AnimationTypeShow)。

问题2：
依据你的描述，传参的形式可以理解为：A->B->C，也就是C需要接受A传递的参数。
按照例子所示，B里面可以拿到A中extras传递的参数。同理，B也可以以同样的道理，传递给C。
采用init中配置子页面的形式，可以将init放在plusready后执行，这样就可以先读取参数，再进行传递。
```
// B页面
mui.plusReady(function(){
var self = plus.webview.currentWebview(); //当前webview对象
var param = self.param; //A传递过来的额外的参数
mui.init({
subpages:[{
url: 'xxx',
id: 'id',
extras:{
param: param
}
}]
});
});
```

关于页面跳转的loading以及展示的时机，可以尝试这样做。
A页面，打开一个waiting。B页面（如果是父子页面，则是子页面C），监听当前webview的loaded事件，然后show当前的webview。
相关的API，参考[plus.webview部分](http://www.html5plus.org/doc/zh_cn/webview.html)。